هي إحدى مؤسسات القطاع العام ذات الطابع الاقتصادي أحدثت بموجب المرسوم رقم 347 لعام1969 وتعود بكاملها للقطاع العام وترتبط بوزارة النقل بموجب المرسوم التشريعي رقم 93 لعام 1974 وهي شركة تنطبق عليها أحكام القانون رقم 2 لعام 2005

تنفيذاً للمرسوم التشريعي رقم /347/ لعام 1969 فقد عملت الشركة في ظل تعدد الوكالات الملاحية، وبقيت على هذا الأساس إلى نهاية عام 1980، وبدأت تعمل بـ/51/ عنصراً, بينما أصبحت في نهاية عام 1977 تضم /133/ عنصراً موزعين على كافة مناحي العمل في اللاذقية وطرطوس. وبعد أن أُحدث الفرع في اللاذقية بموجب قرار وزارة النقل رقم /608/ بتاريخ 26/7/1977، وعلى ضوء التوسع، تم تجزئة الجهاز الوظيفي ليشمل كلاً من الإدارة المركزية، وفرع اللاذقية، وفرع طرطوس، وأُحدث فرع بانياس بموجب قرار وزارة النقل رقم /127/ تاريخ 10/2/1977.

نتيجة الدراسات المتعلقة بواقع التوكيل الملاحي الذي كان سائداً في ذلك الوقت، صدر كتاب رئاسة مجلس الوزراء رقم 5341/1/31 تاريخ 30/10/1980، الذي حدد مطلع عام 1981 البدء بحصر وكالة جميع سفن الحاويات بوكالة الشركة، وأصبحت الوكيلة الوحيدة بالقطر لكافة الشركات الملاحية وأصحاب السفن والناقلات التي تسير سفنها وناقلاتها إلى المرافئ والمصبات السورية.

تنفيذاً للمرسوم التشريعي رقم /55/ لعام 2002 تم السماح بجواز الترخيص للأشخاص الطبيعيين والاعتباريين بمزاولة أعمال الوكالة البحرية للسفن التجارية التي تؤم المرافئ السورية والتي تقوم بنقل الركاب أو بضائع القطاع الخاص أو بضائع العبور وفق الأسس والشروط ونسب البدلات التي تضعها وزارة النقل.

تتولى الشركة جميع الخدمات اللازمة للسفن وناقلات النفط التي تؤم مرافئ ومصبات القطر وخاصةً أعمال الاستقبال والتسفير والترحيل، وتموين السفن، وخدمة المسافرين، والإشراف على نقل البضائع من السفن إلى الرصيف وبالعكس، وغير ذلك من المساعدات والخدمات التي تتعاطاها عادةً وكالات خدمة السفن.